RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wbp4Q61048 376 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ei24Q61070 340 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Npy6rQ61212 371 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxb2Q64733 428 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35e3Q6PGC7 313 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sema6dQ76KF0 1073 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr843Q7TRG4 313 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr452Q7TRV8 317 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem106bQ80X71 275 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb21Q8C5Z4 100 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CcnqQ8QZR8 250 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcgf1Q8R023 259 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Angptl6Q8R0Z6 457 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TbccQ8VCN9 341 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinb7Q9D695 380 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Naa10Q9QY36 235 aa9.22□□□□□ -0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lao1B1ARV3 523 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm45062E0CZ38 131 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd16E9Q173 522 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dhrs3O88876 302 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il5P04401 133 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk1b22P15948 259 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 StumQ0VBF8 141 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp72Q0VFY0 435 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RasefQ5RI75 627 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 5730522E02RikQ5SP45 163 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 St6gal2Q76K27 524 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B630019K06RikQ7TNS5 333 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem200aQ8C817 491 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Las2Q8CB14 526 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd99Q8VCN6 175 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr995Q8VF74 315 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1261Q8VFB0 306 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr308Q8VFP2 308 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gatad2bQ8VHR5 594 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr13Q91V09 485 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NpntQ91V88 561 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PccbQ99MN9 541 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps36Q9CQX8 102 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem42Q9CR22 157 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Steap1Q9CWR7 339 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem175Q9CXY1 499 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TsfmQ9CZR8 324 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cst6Q9D1B1 149 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam89bQ9QUI1 189 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asic5Q9R0Y1 495 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cib1Q9Z0F4 191 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl8Q9Z121 97 aa9.21□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm37596A0A0A6YXL2 336 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1025-ps1A0A140T8K3 312 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IsxA1A546 240 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh8D3Z6W3 317 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcstv1O70619 171 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HbzP06467 142 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgf5P15656 264 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc42P60766 191 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gng3P63216 75 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atf1P81269 269 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb4P82019 63 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem211Q3UUA0 195 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Them4Q3UUI3 230 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psg17Q62056 475 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wipf2Q6PEV3 440 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt2a1Q80X89 528 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elovl5Q8BHI7 299 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plcxd3Q8BLJ3 321 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdfy2Q8BUB4 400 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C8gQ8VCG4 202 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr648Q8VG19 316 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taf9Q8VI33 264 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Coq5Q9CXI0 327 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Egr4Q9WUF2 478 aa9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FasnP19096 2504 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv1-31A0A0A6YWK5 117 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A286YDM2 672 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1157A2AVC4 312 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt83E9Q1Y9 479 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gnao1P18872 354 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Id1P20067 168 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Htr5aP30966 357 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LepP41160 167 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lad1P57016 528 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Doc2bP70169 412 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf2Q60843 354 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf354aQ61751 572 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zic3Q62521 466 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tusc1Q673H1 205 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taf9bQ6NZA9 249 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CapslQ6P8Y1 208 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr875Q7TRE5 310 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SvopQ8BFT9 548 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LsampQ8BLK3 341 aa9.19□□□□□ -0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pqlc2Q8C4N4 293 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.8 ms