RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC35E3Q7Z769 313 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SYS1Q8N2H4 156 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ALG1L2C9J202 215 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 GFYI3L273 518 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 OR11G2Q8NGC1 345 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FGF17O60258 216 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 HES3Q5TGS1 186 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM108Q6UXF1 575 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 PPICP45877 212 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 C16orf82Q7Z2V1 217 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 B9D1Q9UPM9 204 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 C10orf113Q5VZT2 155 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA45Q537H7 98 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 WNT5AP41221 380 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR81Q562E7 1941 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2W5A6NFC9 320 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SYT8Q8NBV8 401 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 VAX2Q9UIW0 290 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXL17Q9UF56 701 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SPTA1P02549 2419 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 B4DEV8 164 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SHISA8B8ZZ34 492 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 PYCR3Q53H96 274 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 MPC2O95563 127 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 STAG3L3P0CL85 134 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 AWAT1Q58HT5 328 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4X1Q8NH49 305 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 HCSTQ9UBK5 93 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 DHRS3O75911 302 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM222BQ8WU58 562 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 GZMKP49863 264 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP250Q9BV73 2442 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CXorf1O96002 111 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 MBPP02686 304 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CCL2P13500 99 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SFRP2Q96HF1 295 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF576Q9H609 170 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A087WUJ7 227 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 MTURNQ8N3F0 131 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 INSIG2Q9Y5U4 225 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 YIPF6Q96EC8 236 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXC1Q12948 553 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FOXB1Q99853 325 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SFT2D2O95562 160 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 RHBDD2Q6NTF9 364 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM219AQ8IW50 185 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2W1Q9Y3N9 320 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 CGB1A6NKQ9 187 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ERASQ7Z444 233 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 RER1O15258 196 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 GAB4Q2WGN9 574 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ADTRPQ96IZ2 230 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TEX101Q9BY14 249 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 PLAUP00749 431 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 ST6GAL1P15907 406 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 AQP10Q96PS8 301 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 RTN4RQ9BZR6 473 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM38BQ9NVV0 291 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 OTOSQ8NHW6 89 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 NPIPB6E9PJ23 425 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM33P57088 247 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 C16orf92Q96LL3 132 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms