RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 CA11O75493 328 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 LCATP04180 440 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 B4GALT1P15291 398 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM11P17152 192 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 CEBPGP53567 150 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 TAS2R46P59540 309 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 SLC35A1P78382 337 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 KMT5CQ86Y97 462 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM156Q8N614 296 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 NEK7Q8TDX7 302 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 SNX22Q96L94 193 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.27□□□□□ -0.92
FCHO1-216ENST00000596536 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 OR5H8P0DN80 308 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CHATP28329 748 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 PIGPP57054 158 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM33P57088 247 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 DKKL1Q9UK85 242 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 RFNGQ9Y644 331 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 ATRXP46100 2492 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 DNAJC13O75165 2243 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 ATMQ13315 3056 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 DHHO43323 396 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CCL4P13236 92 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CLDN23Q96B33 292 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 ADGRG7Q96K78 797 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 AK3Q9UIJ7 227 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 PADI1Q9ULC6 663 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.27□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 A0A0J9YW62 118 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 HSPA12AO43301 675 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 TCF21O43680 179 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 NXPH3O95157 252 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 AMBPP02760 352 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 OR5AC1P0C628 307 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 NTF4P34130 210 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 RBX1P62877 108 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 MAJINQ3KP22 176 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SLC22A25Q6T423 547 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 COMMD1Q8N668 190 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 DIRC2Q96SL1 478 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 A0A0G2JMM0 328 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PPB8 328 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1W2PRS3 328 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 C3orf80F5H4A9 247 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 TP53I11O14683 189 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CST4P01036 141 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 PGA5P0DJD9 388 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CCL1P22362 96 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 OR3A1P47881 315 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 HIST3H3Q16695 136 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 HAS2Q92819 552 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 NABP1Q96AH0 204 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 RAB39BQ96DA2 213 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 HSPB6O14558 160 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 TGOLN2O43493 480 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CCNOP22674 350 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.26□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.25□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.25□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
FCHO1-216ENST00000596536 OR4A8P0C604 315 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms