RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 XPNPEP2O43895 674 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF737O75373 536 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCNKO75909 580 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ARG1P05089 322 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CD2P06729 351 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 LIMS3P0CW19 117 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 LIMS4P0CW20 117 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF728P0DKX0 622 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF44P15621 663 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SPNP16150 400 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RAB3AP20336 220 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB9P28065 219 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ETV1P50549 477 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NCS1P62166 190 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CDK10Q15131 360 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 KISS1Q15726 138 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MIDNQ504T8 468 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC190Q86UF4 302 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR5R1Q8NH85 324 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GPR148Q8TDV2 347 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MYDGFQ969H8 173 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM80Q96HE8 168 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SSX3Q99909 188 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF649Q9BS31 505 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ING3Q9NXR8 418 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF221Q9UK13 617 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CENPXA8MT69 81 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NOTOA8MTQ0 251 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf98A8MV24 154 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 H3BUX3 64 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MGST3O14880 152 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DEGS1O15121 323 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 AIREO43918 545 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PSPNO60542 156 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 KDM4BO94953 1096 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA7O95182 113 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR2H2O95918 312 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1D-12P01611 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 M6PRP20645 277 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 S100A5P33763 92 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GNG2P59768 71 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PPP3R1P63098 170 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RELBQ01201 579 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IRF3Q14653 427 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF146Q15072 292 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CDK5R1Q15078 307 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 LY6EQ16553 131 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TAF9Q16594 264 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC58Q4VC31 144 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 HCP5Q6MZN7 132 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RNF144BQ7Z419 303 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF714Q96N38 554 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 S100A13Q99584 98 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SLITRK2Q9H156 845 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PPA2Q9H2U2 334 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DIABLOQ9NR28 239 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RNF114Q9Y508 228 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 FAM25AB3EWG3 89 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 FAM25CB3EWG5 89 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 FAM25GB3EWG6 89 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 HTR3BO95264 441 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 CDK1P06493 297 aa6.77□□□□□ -1.33
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