RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GZMMP51124 257 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 VAMP7P51809 220 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HCCSP53701 268 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN15P56746 228 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PIGFQ07326 219 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LY6DQ14210 128 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ST3GAL2Q16842 350 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 CD99P14209 185 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF19P17023 458 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ORM2P19652 201 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PRTN3P24158 256 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CDK2P24941 298 aa2.57□□□□□ -2
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