RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 FAM106CPP0CH98 169 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 CA13Q8N1Q1 262 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 STRCP1A6NGW2 1772 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ASPDHA6ND91 283 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ATP6V1FQ16864 119 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 MRGPREQ86SM8 312 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 YIPF6Q96EC8 236 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 WBP1LQ9NX94 342 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ARID2Q68CP9 1835 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R2P9O14990 202 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NKX2-2O95096 273 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 POM121Q96HA1 1249 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PITX3O75364 302 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 LALBAP00709 142 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 B2MP61769 119 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ASB5Q8WWX0 329 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.48□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ZAR1LA6NP61 321 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 MBTPS2O43462 519 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PMS2P2O95744 297 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ZNF117Q03924 483 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 SPICQ8N5J4 248 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 IFITM10A6NMD0 228 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ABLIM3O94929 683 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 TGFAP01135 160 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 GABRG2P18507 467 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 UCNP55089 124 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NTNG2Q96CW9 530 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 GPR35Q9HC97 309 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 DDOSTP39656 456 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 HIST1H3AP68431 136 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 CD300CQ08708 224 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 FZD2Q14332 565 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 LANCL1O43813 399 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NID1P14543 1247 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 CD33P20138 364 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 GNG3P63215 75 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 AQP6Q13520 282 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PTPRFP10586 1907 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 UPK1AO00322 258 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 CD22P20273 847 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 PDLIM4P50479 330 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 FUT6P51993 359 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 DAPP1Q9UN19 280 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 S4R3C0 116 aa7.47□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NKX2-8O15522 239 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 GABRB1P18505 474 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NMUP48645 174 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ARF6P62330 175 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 ZNF154Q13106 437 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 NIT2Q9NQR4 276 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 TINAGQ9UJW2 476 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 OOEPA6NGQ2 149 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 CRPP02741 224 aa7.46□□□□□ -1.21
PDPR-210ENST00000568530 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms