RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 ACTBL2Q562R1 376 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 ERGIC1Q969X5 290 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 BEX2Q9BXY8 128 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 BEX1Q9HBH7 125 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 GLS2Q9UI32 602 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 OR2AT4A6NND4 320 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 TAS2R46P59540 309 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 EHFQ9NZC4 300 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 EDARQ9UNE0 448 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 ALG5Q9Y673 324 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC2-208ENST00000566635 TMEM82A0PJX8 343 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 GLAP06280 429 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ARPC4P59998 168 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ZNF286AQ9HBT8 521 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 HPXP02790 462 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 IFNA6P05013 189 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 LMO1P25800 156 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 OR3A3P47888 321 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 IFITM2Q01629 132 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 Q9N2K0 584 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 SOD3P08294 240 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 IRF2P14316 349 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 PRDX2P32119 198 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 GABRA2P47869 451 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 OR3A1P47881 315 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 BTG1P62324 171 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 C6orf183Q5T699 404 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 PRRT1Q99946 306 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ZNF222Q9UK12 451 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 CDK10Q15131 360 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 SHEQ5VZ18 495 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 CCDC107Q8WV48 283 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 A6NNC1 897 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 IFNL4K9M1U5 179 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 PEX14O75381 377 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 CD8AP01732 235 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 TSPAN5P62079 268 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 AKAP14Q86UN6 197 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 CCL17Q92583 94 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DSCAMO60469 2012 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 LRRC30A6NM36 301 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 PPOXP50336 477 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ZMYND11Q15326 602 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 AGAP6Q5VW22 663 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 A0A1B0GW55 424 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 OOEPA6NGQ2 149 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ZNF737O75373 536 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DHFRP00374 187 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 RLN1P04808 185 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 SELLP14151 372 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 STUMQ69YW2 141 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 COQ2Q96H96 371 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC2-208ENST00000566635 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms