RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561436.1

HERC1-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, human

TSL 4

Gene HERC1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC1-215	ENST00000561436	TUBG1	P23258	451 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	HMOX2	P30519	316 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	GLRX	P35754	106 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CRYBB2	P43320	205 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	MAGEA12	P43365	314 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	KRTAP12-2	P59991	146 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C2orf80	Q0P641	193 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	FOXF1	Q12946	379 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	GNA13	Q14344	377 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	HERPUD1	Q15011	391 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	QPRT	Q15274	297 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	DGUOK	Q16854	277 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CASC10	Q5T4H9	136 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	GPR157	Q5UAW9	335 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	TMEM107	Q6UX40	140 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF546	Q86UE3	836 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PNKD	Q8N490	385 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	COX18	Q8N8Q8	333 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	DOK4	Q8TEW6	326 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	DDIT4L	Q96D03	193 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	SLC35E1	Q96K37	410 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C1orf198	Q9H425	327 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	BEX1	Q9HBH7	125 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	2.58	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PSMB11	A5LHX3	300 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C5orf63	A6NC05	138 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	TMEM114	B3SHH9	223 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436		E9PBE3	544 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	FOXH1	O75593	365 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CSTA	P01040	98 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PTH	P01270	115 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ETS2	P15036	469 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	GSS	P48637	474 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	UGT2B15	P54855	530 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF117	Q03924	483 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	MERTK	Q12866	999 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PSG7	Q13046	419 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	SKP2	Q13309	424 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C16orf87	Q6PH81	154 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	AAED1	Q7RTV5	226 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	SFXN5	Q8TD22	340 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	RAB1C	Q92928	201 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	SLC35B4	Q969S0	331 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PPCDC	Q96CD2	204 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	LRRC58	Q96CX6	371 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	FCRL1	Q96LA6	429 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	MBOAT4	Q96T53	435 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	FMO2	Q99518	471 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	C1orf109	Q9NX04	203 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	NUP50	Q9UKX7	468 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	ABCA4	P78363	2273 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		2.57	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC1-215	ENST00000561436	MED13L	Q71F56	2210 aa		2.56	□□□□□ -2

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