RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 B8ZZF3 427 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 E7EQL1 145 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV1-46P01743 117 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PGAM2P15259 253 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 EGR1P18146 543 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FPR2P25090 351 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFHR2P36980 270 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHRS2Q13268 280 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R1AQ13522 171 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGSF11Q5DX21 431 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEUROG1Q92886 237 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C5orf66Q9H5L9 145 aa15.01□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FABP7O15540 132 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIAH2O43255 324 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADH4P08319 380 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCTP09683 121 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB25P24278 435 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SERPINF1P36955 418 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GATA4P43694 442 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOXA1Q86UR1 476 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCGB3A2Q96PL1 93 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHIAQ9BZP6 476 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM165Q9HC07 324 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL19Q9UHD0 177 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLS2Q9UI32 602 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF115Q9Y4L5 304 aa15□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 VAMP1P23763 118 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FCGR2CP31995 323 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q6ZS49 121 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 LYG2Q86SG7 212 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPICQ8N5J4 248 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 ROS1P08922 2347 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 HCFC1P51610 2035 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRDCB7Z8K6 153 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIX6O95475 246 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNFSF4P23510 183 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIRC2Q96SL1 478 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.99□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C9orf170A2RU37 121 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRRM5B3KS81 715 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOSR2O14653 212 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSPNO60542 156 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KNG1P01042 644 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C1QBP02746 253 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAS2R31P59538 309 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 FXYD4P59646 89 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL13RA1P78552 427 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOMM40LQ969M1 308 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM230Q96A57 120 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 DLL4Q9NR61 685 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TREM2Q9NZC2 230 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 METRNQ9UJH8 293 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CACNA1DQ01668 2161 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 C17orf100A8MU93 164 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 BET1O15155 118 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLAUP00749 431 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD55P08174 381 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD34P28906 385 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLP1RP43220 463 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 EFNB3Q15768 340 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNJ8Q15842 424 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms