RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PARVA	Q9NVD7	372 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PSG8	Q9UQ74	426 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WUJ7	227 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6C6	A6NF89	314 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf87	E5RJ46	101 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM250	H0YL14	139 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957		M0QYV0	167 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	LAD1	O00515	517 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	FFAR1	O14842	300 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PI15	O43692	258 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC37A4	O43826	429 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC22	O60826	627 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DHFR	P00374	187 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNA21	P01568	189 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GUSB	P08236	651 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4Q2	P0C623	313 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CD79A	P11912	226 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CYBA	P13498	195 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SPN	P16150	400 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK2	P20151	261 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINB1	P30740	379 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DRD3	P35462	400 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TALDO1	P37837	337 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYBA4	P53673	196 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GFER	P55789	205 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R46	P59540	309 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DAD1	P61803	113 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35A2	P78381	396 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IFITM2	Q01629	132 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PAX8	Q06710	450 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SKP2	Q13309	424 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PNOC	Q13519	176 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NSDHL	Q15738	373 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	GSG1	Q2KHT4	349 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00303	Q3SY05	128 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf99	Q4VX62	202 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10K2	Q6IF99	312 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CGB2	Q6NT52	195 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF774	Q6NX45	483 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	XKRX	Q6PP77	449 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	S100A7A	Q86SG5	101 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8N377	158 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf29	Q8N999	325 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NPB	Q8NG41	125 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM151A	Q8WW52	585 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	BORCS7	Q96B45	105 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SFRP2	Q96HF1	295 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM8	Q96KF7	97 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	BMF	Q96LC9	184 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF649	Q9BS31	505 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM4	Q9C037	500 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	HES4	Q9HCC6	221 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	DOK5	Q9P104	306 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK13	Q9UKR3	277 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNM	O15061	1565 aa		2.02	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3C2G	O75747	1445 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NOS1	P29475	1434 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP160	Q12769	1436 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	NFASC	O94856	1347 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GV50	99 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM159B	A6NKW6	160 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP5D1	E7EU14	171 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957		K7EPK0	472 aa		2.01	□□□□□ -2.09
AKAP13-223	ENST00000560957	COPE	O14579	308 aa		2.01	□□□□□ -2.09

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