RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 C1orf159Q96HA4 380 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 C18orf12Q96KH6 178 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PECRQ9BY49 303 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ING3Q9NXR8 418 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ETAA1Q9NY74 926 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 DUX4Q9UBX2 424 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 SPG11Q96JI7 2443 aa7.31□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 A0A0A6YYD4 124 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 A0A1W2PPE2 198 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 A0A1W2PQ09 198 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 A0A1W2PR64 198 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 A0A1W2PRV1 198 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 SERPINE3A8MV23 424 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 A8MXK9 166 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 XRCC3O43542 346 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 MT-ND4P03905 459 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 CD3GP09693 182 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 FOSL1P15407 271 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ELK1P19419 428 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 GZMHP20718 246 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 GATA3P23771 443 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 GLIPR1P48060 266 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 P2RX3P56373 397 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PITPNAQ00169 270 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ARFRP1Q13795 201 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TMEM186Q96B77 213 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.3□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ODAMA1E959 279 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 CLPXO76031 633 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TPPPO94811 219 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 INHBBP09529 407 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 GNB3P16520 340 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 CDK2P24941 298 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TNFSF8P32971 234 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 GNG2P59768 71 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PAX5Q02548 391 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 BIVMQ86UB2 503 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 FGFRL1Q8N441 504 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 DTX3Q8N9I9 347 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 CORO2AQ92828 525 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.29□□□□□ -1.24
APH1B-210ENST00000560890 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms