RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	C17orf51	A8MQB3	221 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TM4SF5	O14894	197 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SHOX	O15266	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ARPC5	O15511	151 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	FSTL3	O95633	263 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	MAGEB1	P43366	347 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	COMMD7	Q86VX2	200 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ST8SIA2	Q92186	375 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CMBL	Q96DG6	245 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		B8ZZF3	427 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM11	P17152	192 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	VDAC1	P21796	283 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TGIF1	Q15583	401 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM104	Q8NE00	496 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	BVES	Q8NE79	360 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PI4KA	P42356	2102 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PPY	P01298	95 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CCNO	P22674	350 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	BAP18	Q8IXM2	172 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PRELID1	Q9Y255	219 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0A6YYD4	124 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667		A6NL46	340 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	MPPED1	O15442	326 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TUSC2	O75896	110 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SERPINE2	P07093	398 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	FCGR2C	P31995	323 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TAF9	Q16594	264 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	STX12	Q86Y82	276 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SNX22	Q96L94	193 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HLA-H	P01893	362 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OR8U8	P0C7N1	319 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	ACKR3	P25106	362 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	GATA4	P43694	442 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	PIGP	P57054	158 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HBG1	P69891	147 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HBG2	P69892	147 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HTD2	P86397	168 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	HES4	Q9HCC6	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-233	ENST00000557667	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	IFNA5	P01569	189 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	CXCL3	P19876	107 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV1-2	P23083	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	NPY4R	P50391	375 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	GPM6A	P51674	278 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	OR10K2	Q6IF99	312 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	GALM	Q96C23	342 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	BEX2	Q9BXY8	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	NBAS	A2RRP1	2371 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	LMX1B	O60663	402 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	MB	P02144	154 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	DBH	P09172	617 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	BCL3	P20749	454 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM187	Q14656	261 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667		Q8TCH9	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	C18orf12	Q96KH6	178 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	JPT1	Q9UK76	154 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	DEDD	O75618	318 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-233	ENST00000557667	IFNA1	P01562	189 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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