RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550558.5

ASIC1-206, Transcript of acid sensing ion channel subunit 1, human

TSL 2

Gene ASIC1, Length 3,819 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC1-206	ENST00000550558		H0YIZ8	118 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	RAB5B	P61020	215 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF724	A8MTY0	619 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	BMP5	P22003	454 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558		Q96M66	194 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	NMES1	Q9C002	83 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	GNG13	Q9P2W3	67 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	TMEM218	A2RU14	115 aa		14.58	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		14.58	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	C9orf172	C9J069	976 aa		14.58	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	SP1	P08047	785 aa		14.58	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	ECI1	P42126	302 aa		14.58	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		14.58	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		14.58	□□□□□ -0.07
ASIC1-206	ENST00000550558		B4E171	279 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	UMAD1	C9J7I0	102 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TSPAN7	P41732	249 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	GUCD1	Q96NT3	240 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF17	P17021	662 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RUNX1	Q01196	453 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CSRP2	Q16527	193 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CST4	P01036	141 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF83	P51522	516 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MPPED1	O15442	326 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CEACAM6	P40199	344 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ERVS71-1	P61550	626 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	HGFAC	Q04756	655 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	C10orf128	Q5T292	105 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TMEM54	Q969K7	222 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TMEM230	Q96A57	120 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558		G3V3Q6	166 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LDLRAD4	O15165	306 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	UBE2K	P61086	200 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RAB11A	P62491	216 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SYNGR3	O43761	229 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF266	Q14584	549 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	OR2C3	Q8N628	320 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	WIPF3	A6NGB9	483 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MELTF	P08582	738 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	OR3A1	P47881	315 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	F2RL1	P55085	397 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ERGIC1	Q969X5	290 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CACNG5	Q9UF02	275 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TTLL8	A6PVC2	850 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558		M0R1B8	84 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SHOX	O15266	292 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ARG1	P05089	322 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	NTF4	P34130	210 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MUCL1	Q96DR8	90 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	CHST1	O43916	411 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	IGKV1D-12	P01611	117 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PPP1CB	P62140	327 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	ZNF154	Q13106	437 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	SH2D1B	O14796	132 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ASIC1-206	ENST00000550558	TAAR5	O14804	337 aa		14.55	□□□□□ -0.08

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