RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ADMP35318 185 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PTGFRP43088 359 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR3A4PP47883 348 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MTNR1BP49286 362 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 EDDM3BP56851 147 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BDH1Q02338 343 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 KLRD1Q13241 179 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 EDDM3AQ14507 147 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 RSU1Q15404 277 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MZT2AQ6P582 158 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 C1QL4Q86Z23 238 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR2C3Q8N628 320 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TMEM203Q969S6 136 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SNX22Q96L94 193 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 DERL3Q96Q80 235 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ING3Q9NXR8 418 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CKLFQ9UBR5 152 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 DEGS1O15121 323 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GPX5O75715 221 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR2H2O95918 312 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 IGHV1-69P01742 117 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF44P15621 663 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BLMHQ13867 455 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF273Q14593 569 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZNF146Q15072 292 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 GRK1Q15835 563 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TOR2AQ5JU69 321 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 Q6P435 159 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR8H2Q8N162 312 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PNKDQ8N490 385 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PXT1Q8NFP0 134 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 Q9H521 79 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ZMAT4Q9H898 229 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 M0R1W7 72 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 HSPB6O14558 160 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SERPINA2P20848 420 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PRTN3P24158 256 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 LMO1P25800 156 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 OR3A1P47881 315 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 AESQ08117 197 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BAMBIQ13145 260 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PIGYQ3MUY2 71 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ELP2Q6IA86 826 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 ASCL4Q6XD76 172 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 UFD1Q92890 307 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 TNFRSF14Q92956 283 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MUL1Q969V5 352 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 S100A13Q99584 98 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MGLLQ99685 303 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SLITRK2Q9H156 845 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 METTL9Q9H1A3 318 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 PPA2Q9H2U2 334 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 RHOFQ9HBH0 211 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 A0A0U1RQK1 487 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PP11 408 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPH5 198 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MGST3O14880 152 aa7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CS-217ENST00000550044 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms