RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 PHB2Q99623 299 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 C5orf51A6NDU8 294 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TMEM210A6NLX4 147 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 H3BUI4 141 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 HAND1O96004 215 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 IGHV3-13P01766 116 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 OR4A8P0C604 315 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FPR2P25090 351 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 GABRA2P47869 451 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ZNF81P51508 661 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ERVK11-1P61568 191 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 Q6P435 159 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 Q8IYB0 196 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 NEUROG1Q92886 237 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TMEM230Q96A57 120 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FXYD6Q9H0Q3 95 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TMEM165Q9HC07 324 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ADAP1O75689 374 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 NAPSAO96009 420 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TK1P04183 234 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ZNF728P0DKX0 622 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 AADACP22760 399 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TUBG1P23258 451 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 PIGPP57054 158 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 HERV-K104P61576 105 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 AESQ08117 197 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 EDDM3AQ14507 147 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SPICQ8N5J4 248 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 KIRREL1Q96J84 757 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 Q9N2K0 584 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 METRNQ9UJH8 293 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 MPTX1A8MV57 137 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ARPC5O15511 151 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 HSPA12AO43301 675 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 HOXB5P09067 269 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SORDQ00796 357 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 IFITM2Q01629 132 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 IL13RA2Q14627 380 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 HERPUD1Q15011 391 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SPERTQ8NA61 448 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 PRORYQ9H606 182 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 JKAMPQ9P055 326 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 OPN4Q9UHM6 478 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 EGR1P18146 543 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ZNF146Q15072 292 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 POC1AQ8NBT0 407 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 MITD1Q8WV92 249 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-215ENST00000549143 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms