RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PELI1	Q96FA3	418 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	HCK	P08631	526 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM106CP	P0CH98	169 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM225B	P0DP42	221 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CDK5R1	Q15078	307 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR9G1	Q8NH87	305 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	C4orf36	Q96KX1	117 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CGB3	P0DN86	165 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CGB7	P0DN87	165 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	GABRB1	P18505	474 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	AQP4	P55087	323 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP10-11	P60412	298 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ZP1	P60852	638 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	KISS1	Q15726	138 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OSR2	Q8N2R0	312 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	TOMM40L	Q969M1	308 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	RPE	Q96AT9	228 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	KIRREL1	Q96J84	757 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SNTN	A6NMZ2	147 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777		H0YJX3	145 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	HSPB6	O14558	160 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SULT1B1	O43704	296 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	GNAO1	P09471	354 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	GLP1R	P43220	463 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MTNR1B	P49286	362 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF691	Q5VV52	312 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	APH1B	Q8WW43	257 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CYGB	Q8WWM9	190 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	LGALS12	Q96DT0	336 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	RDH12	Q96NR8	316 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CALY	Q9NYX4	217 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	KIF25	Q9UIL4	384 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777		J3QR06	171 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-7	P01780	117 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	GALE	Q14376	348 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ELP2	Q6IA86	826 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF329	Q86UD4	541 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	LEAP2	Q969E1	77 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF649	Q9BS31	505 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ALG8	Q9BVK2	526 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	HES1	Q14469	280 aa		12.72	□□□□□ -0.37

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