RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 PARP14Q460N5 1801 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF727A8MUV8 499 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 B9A039 149 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FOXH1O75593 365 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 CLDN14O95500 239 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 FCER1GP30273 86 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-204ENST00000538708 LCN2P80188 198 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 LINC00303Q3SY05 128 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRB-204ENST00000538708 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.24□□□□□ -1.09
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