RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6P435 159 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFRSF14Q92956 283 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM46BQ96A09 425 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 BANF2Q9H503 90 aa9.37□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1W2PP11 408 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 MEGF11A6BM72 1044 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM172BPA6NC97 362 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CPEP16870 476 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TPBGQ13641 420 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAM1Q15629 374 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TAF9Q16594 264 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PLA1AQ53H76 456 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 ASCL4Q6XD76 172 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6YL49 198 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TCF23Q7RTU1 214 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 OR4D6Q8NGJ1 314 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PHYHIPQ92561 330 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CHIAQ9BZP6 476 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CST11Q9H112 138 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PLGRKTQ9HBL7 147 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 IL36GQ9NZH8 169 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF25Q9UIL4 384 aa9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 C17orf98A8MV24 154 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 ARL6IP5O75915 188 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 MGMTP16455 207 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 SRMP19623 302 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 OMGP23515 440 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CDK2P24941 298 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 NFYBP25208 207 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 LMO1P25800 156 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PAX6P26367 422 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 DLX6P56179 175 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 LTC4SQ16873 150 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 MIDNQ504T8 468 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00596Q86U02 117 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 NDNFQ8TB73 568 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 C17orf50Q8WW18 174 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 COQ2Q96H96 371 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 UQCC2Q9BRT2 126 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CUBNO60494 3623 aa9.35□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 H3BUX3 64 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CLDN34H7C241 214 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 MPIG6BO95866 241 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 RBP4P02753 201 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CSN2P05814 226 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 UCHL1P09936 223 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 HTR2CP28335 458 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 GABRA5P31644 462 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 IER3P46695 156 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 FABP5Q01469 135 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 P2RY14Q15391 338 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 MPV17LQ2QL34 196 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB12Q6IQ22 244 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 HCP5Q6MZN7 132 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 C16orf87Q6PH81 154 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 CDH26Q8IXH8 852 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 C3orf56Q8N813 242 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.34□□□□□ -0.91
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.33□□□□□ -0.92
UBASH3B-208ENST00000533451 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms