RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393		Q499Y3	187 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM219	Q86XT9	240 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	GHSR	Q92847	366 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	COQ2	Q96H96	371 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	NFYB	P25208	207 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	CD34	P28906	385 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	OR3A4P	P47883	348 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR176	Q14439	515 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	PIGY	Q3MUY2	71 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	LINC00596	Q86U02	117 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	THRSP	Q92748	146 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	GGH	Q92820	318 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBBP4-215	ENST00000524393	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	CDRT1	O95170	752 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	LALBA	P00709	142 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	SERPINA2	P20848	420 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	MNDA	P41218	407 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393		Q8NFD4	153 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF702P	Q9H963	129 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A087X0M5	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1B0GX30	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	OOSP1	A8MZH6	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	XPNPEP2	O43895	674 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	TSPAN15	O95858	294 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	IGLV1-47	P01700	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	GNAO1	P09471	354 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	GTF2F2	P13984	249 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	FST	P19883	344 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	WNT4	P56705	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	DEFA6	Q01524	100 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393		Q8N2B8	174 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	KIRREL1	Q96J84	757 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	OR14A2	Q96R54	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	WIPF1	O43516	503 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	FBXO24	O75426	580 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RBBP4-215	ENST00000524393	GPX5	O75715	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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