RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 C17orf51A8MQB3 221 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF43P17038 809 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TCN2P20062 427 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 GRPRP30550 384 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.36□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF524Q96C55 264 aa7.36□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1B0GTH9 108 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 E5RGE8 158 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 H3BMH7 237 aa7.36□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 UTS2O95399 124 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CFHR1Q03591 330 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 GPR157Q5UAW9 335 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 Q7L0L9 218 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR1L3Q8NH93 324 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.36□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 NSG2Q9Y328 171 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1B0GVT2 93 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR5B21A6NL26 309 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 GPR137BO60478 399 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TRAPPC6AO75865 159 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FOXL2P58012 376 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ARL6IP1Q15041 203 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 NSDHLQ15738 373 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PRR27Q6MZM9 219 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IL22RA2Q969J5 263 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 APH1AQ96BI3 265 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TSSK2Q96PF2 358 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ALG12Q9BV10 488 aa7.36□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 CACNA1EQ15878 2313 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 TIAF1O95411 115 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 MMP9P14780 707 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CD33P20138 364 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 GRK6P43250 576 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CLDN6P56747 220 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.35□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.35□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CLN8Q9UBY8 286 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 AK3Q9UIJ7 227 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.35□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 AQP7P3A6NL99 342 aa7.35□□□□□ -1.23
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TRPS1-209ENST00000519674 CORTO00230 105 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 DUX1O43812 170 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 DDAH2O95865 285 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV3-11P04433 115 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IGLC2P0DOY2 106 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 IGLC3P0DOY3 106 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 CDKN1AP38936 164 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 EGR4Q05215 589 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF74Q16587 644 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 OR4S2Q8NH73 311 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF721Q8TF20 911 aa7.35□□□□□ -1.23
TRPS1-209ENST00000519674 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.35□□□□□ -1.23
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