RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF766	Q5HY98	468 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193		Q8IYB0	196 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2A7	Q96R45	310 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TXN2	Q99757	166 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SOX7	Q9BT81	388 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR2D2	Q9H210	308 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GPR35	Q9HC97	309 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PATJ	Q8NI35	1801 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR5B21	A6NL26	309 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SYNGR2	O43760	224 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MT-CO3	P00414	261 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SPP1	P10451	314 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DTYMK	P23919	212 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MAGEA5	P43359	124 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MEOX2	P50222	304 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	HES1	Q14469	280 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MPV17L	Q2QL34	196 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF519	Q8TB69	540 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FAM210B	Q96KR6	192 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF488	Q96MN9	340 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TAAR6	Q96RI8	345 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CNIH1	O95406	144 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DEFA4	P12838	97 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MPG	P29372	298 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CHRNA7	P36544	502 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	P2RY1	P47900	373 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RBPJ	Q06330	500 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	BTNL8	Q6UX41	500 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	M1AP	Q8TC57	530 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	GPHA2	Q96T91	129 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		7.04	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TRDC	B7Z8K6	153 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TGOLN2	O43493	480 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV3-11	P04433	115 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ISG15	P05161	165 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FABP1	P07148	127 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PGA4	P0DJD7	388 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF17	P17021	662 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF83	P51522	516 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	P2RY4	P51582	365 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1CB	P62140	327 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IL24	Q13007	206 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	FAM27B	Q5VT28	67 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM18	Q96B42	140 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf35	Q96D05	121 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TINAG	Q9UJW2	476 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SBF1	O95248	1867 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CT45A6	P0DMU7	189 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CT45A5	P0DMU8	189 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CT45A7	P0DMV0	189 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6V0C	P27449	155 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SULT1A1	P50225	295 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-DRB3	P79483	266 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ABCA1	O95477	2261 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	IFI6	P09912	130 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2G1	P62253	170 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	PRR27	Q6MZM9	219 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	SHISA5	Q8N114	240 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NEK1-208	ENST00000512193	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		7.03	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms