RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 SPACA5Q96QH8 159 aa9.56□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF649Q9BS31 505 aa9.56□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.56□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.56□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ZFP57Q9NU63 452 aa9.56□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.56□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.56□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SNTNA6NMZ2 147 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 J3QLW9 94 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 HCKP08631 526 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF19P17023 458 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SLC6A1P30531 599 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 RASSF2P50749 326 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SLC35B1P78383 322 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 HES1Q14469 280 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 Q6P435 159 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF329Q86UD4 541 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 TOMM40LQ969M1 308 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 RNFT2Q96EX2 444 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 COQ2Q96H96 371 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.55□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MEIKINA0A087WXM9 373 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A18PA6NE21 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SERPINE3A8MV23 424 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A12PA8MX19 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 NUDT19A8MXV4 375 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 J3QR06 171 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM11P17152 192 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MTNR1BP49286 362 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 THBS3P49746 956 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 RAB7AP51149 207 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MADCAM1Q13477 382 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 KISS1Q15726 138 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 DRAM1Q8N682 238 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OR56B4Q8NH76 319 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 KIRREL1Q96J84 757 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.54□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 H0YJX3 145 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 HSPB6O14558 160 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MAGEB3O15480 346 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 CGB3P0DN86 165 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 CGB7P0DN87 165 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 VSIG8P0DPA2 414 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 MYCNOSP40205 109 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 GLP1RP43220 463 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 HNF4GQ14541 408 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 CDK5R1Q15078 307 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OR8H3Q8N146 312 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 COMMD1Q8N668 190 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 B9D2Q9BPU9 175 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 CALYQ9NYX4 217 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 KIF25Q9UIL4 384 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 PSG11Q9UQ72 335 aa9.53□□□□□ -0.88
CNOT4-211ENST00000498534 J3QRE1 110 aa9.52□□□□□ -0.89
CNOT4-211ENST00000498534 FGF16O43320 207 aa9.52□□□□□ -0.89
CNOT4-211ENST00000498534 SULT1B1O43704 296 aa9.52□□□□□ -0.89
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV3-7P01780 117 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 204.3 ms