RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFOD1Q9NXC2 390 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C21orf140B9A014 251 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPB6O14558 160 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DIRAS3O95661 229 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STOML3Q8TAV4 291 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIME1Q9H400 295 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB18Q9NP72 206 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AK3Q9UIJ7 227 aa13.39□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5H8P0DN80 308 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS54Q6PEW0 395 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BORCS8Q96FH0 119 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf50Q96LR7 162 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP4M1O00189 453 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XRCC2O43543 280 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYTIPO60759 359 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MED6O75586 246 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFNA2P01563 188 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARG1P05089 322 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRYGSP22914 178 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAMTQ14353 236 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LHFPL1Q86WI0 220 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF141Q8WVD5 230 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PP6455Q8WZ26 134 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL11Q969Q4 196 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALT7Q9UBV7 327 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIHO43447 177 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP1P28562 367 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL14Q8N1E6 418 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5L1Q8NGL2 311 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPHA2Q96T91 129 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABI3Q9P2A4 366 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 V9GYS6 101 aa13.38□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL12A1Q99715 3063 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSTNO14793 375 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS2P15880 293 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASCL1P50553 236 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGPP57054 158 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGPP2Q8IWX5 399 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR10D4PQ8NGN7 298 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEU1Q99519 415 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL9Q9H1A3 318 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0U1RQV5 110 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRA1O75019 489 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGHV2-5P01817 119 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBP02144 154 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFTA3P0C7M3 94 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOX8P57073 446 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB35Q15286 201 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF766Q5HY98 468 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REC114Q7Z4M0 266 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEC11CQ9BY50 192 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRDM13Q9H4Q3 707 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.37□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINE3A8MV23 424 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYNGR4O95473 234 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEXAP06865 529 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGAP20933 346 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S100A2P29034 98 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDTP30046 118 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPP30P78346 268 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A25Q6T423 547 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POC1AQ8NBT0 407 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IP6K3Q96PC2 410 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FIGNL2A6NMB9 653 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF708P17019 499 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFA6P56556 154 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GGNBP1Q5YKI7 109 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLCXD3Q63HM9 321 aa13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALHM1Q8IU99 346 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms