RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 DERL3Q96Q80 235 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LIME1Q9H400 295 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 KCNK15Q9H427 330 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SP140LQ9H930 580 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP57Q9NU63 452 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 STUB1Q9UNE7 303 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SSR3Q9UNL2 185 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 V9GYS6 101 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA4P78363 2273 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0B4J203 849 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IQCF6A8MYZ5 107 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF732B4DXR9 585 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 M0QZ24 198 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MLNRO43193 412 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CTAG2O75638 210 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SC5DO75845 299 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LY6HO94772 140 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 NRASP01111 189 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-13P01766 116 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CD2P06729 351 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SOD3P08294 240 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HCKP08631 526 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 UCHL1P09936 223 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LYNX1P0DP58 116 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF250P15622 560 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ADRA2CP18825 462 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ATF1P18846 271 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SRMP19623 302 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PAX7P23759 505 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CDKN1AP38936 164 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DDOSTP39656 456 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GLIPR1P48060 266 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MMP15P51511 669 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GPM6AP51674 278 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CLDN12P56749 244 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP10-5P60370 271 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 P2RY14Q15391 338 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR8B8Q15620 311 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TRAM1Q15629 374 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HES5Q5TA89 166 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PLCXD3Q63HM9 321 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf88Q6PI97 169 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SSX8Q7RTT4 187 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC190Q86UF4 302 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MUC15Q8N387 334 aa3.94□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 NUP37Q8NFH4 326 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR8G5Q8NG78 346 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ISOC1Q96CN7 298 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RNF170Q96K19 258 aa3.94□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 GFI1Q99684 422 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CSTL1Q9H114 145 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RGCCQ9H4X1 137 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM100Q9NV29 134 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PLCE1Q9P212 2302 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ANXA2P2A6NMY6 339 aa3.93□□□□□ -1.78
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