RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 BAMBIQ13145 260 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TRAM1Q15629 374 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TAF9Q16594 264 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 OR10K2Q6IF99 312 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 Q6YL49 198 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 Q6ZPA2 131 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SVOPQ8N4V2 548 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CORO2AQ92828 525 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FAM46BQ96A09 425 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 Q96M66 194 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CHIAQ9BZP6 476 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 METTL9Q9H1A3 318 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 BANF2Q9H503 90 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 KIF25Q9UIL4 384 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 LRRC42Q9Y546 428 aa7.24□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 A0A0A6YYD4 124 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 hADV38S2A0JD32 116 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 MEIOCA2RUB1 952 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 VSIG8P0DPA2 414 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GTF2F2P13984 249 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GUCA2AQ02747 115 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PLA2G7Q13093 441 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 MPV17LQ2QL34 196 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 MIDNQ504T8 468 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF626Q68DY1 528 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 BRICD5Q6PL45 260 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 LINC00596Q86U02 117 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GAPTQ8N292 157 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 DYRK2Q92630 601 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ING3Q9NXR8 418 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GLS2Q9UI32 602 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 A0A1W2PPH5 198 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FAM172BPA6NC97 362 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CCRL2O00421 344 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SLC17A2O00624 439 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 LDLRAD4O15165 306 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ARL6IP5O75915 188 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 OMGP23515 440 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CFPP27918 469 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PSMB9P28065 219 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SSTR5P35346 364 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 IER3P46695 156 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 CLDN12P56749 244 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 RELBQ01201 579 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 BLMHQ13867 455 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 GPR176Q14439 515 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FBLN7Q53RD9 439 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 C22orf42Q6IC83 251 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FCGR1BQ92637 280 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 JMJD8Q96S16 334 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 NICN1Q9BSH3 213 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TM2D1Q9BX74 207 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.22□□□□□ -1.25
POLR1A-207ENST00000483538 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-207ENST00000483538 A0A087X0M5 115 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR1A-207ENST00000483538 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms