RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.7□□□□□ -0.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 WASF3Q9UPY6 502 aa11.7□□□□□ -0.54
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SH3BP1-206ENST00000469947 CEACAM1P13688 526 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 LTBRP36941 435 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 PTGDSP41222 190 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 COL10A1Q03692 680 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 GAPTQ8N292 157 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR27Q9NS67 375 aa11.66□□□□□ -0.54
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