RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF732	B4DXR9	585 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	LDLRAD4	O15165	306 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	PAH	P00439	452 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	GPM6A	P51674	278 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	BMX	P51813	675 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	QRFP	P83859	136 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	HES5	Q5TA89	166 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308		Q8NFD4	153 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	GPER1	Q99527	375 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	IL36G	Q9NZH8	169 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TSSC4-208	ENST00000467308	ARSB	P15848	533 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RAB6A	P20340	208 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR3A4P	P47883	348 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	IL24	Q13007	206 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	LSAMP	Q13449	338 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	GPR176	Q14439	515 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM189A2	Q15884	450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF144B	Q7Z419	303 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	FGFRL1	Q8N441	504 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CFHR4	Q92496	578 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SPACA5	Q96QH8	159 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CCL13	Q99616	98 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ABCG5	Q9H222	651 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PPA2	Q9H2U2	334 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1B0GW55	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		J3QT63	122 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CTDSP2	O14595	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	NDUFB3	O43676	98 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	APOA1	P02647	267 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	S100A5	P33763	92 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SAA4	P35542	130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ETV6	P41212	452 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	POU3F4	P49335	361 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	UBE2E1	P51965	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	EFNB2	P52799	333 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	AWAT2	Q6E213	333 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	WDR86	Q86TI4	376 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	MKX	Q8IYA7	352 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		Q8N7P7	452 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC29	Q8WV35	223 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TNFRSF14	Q92956	283 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX4	Q9UBX2	424 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A0B4J203	849 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	MEIOC	A2RUB1	952 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	TPPP	O94811	219 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	VSIG8	P0DPA2	414 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	KIR2DS4	P43632	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	HAAO	P46952	286 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CLDN12	P56749	244 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	P2RY14	Q15391	338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	ELP2	Q6IA86	826 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	WDR82	Q6UXN9	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	CALHM1	Q8IU99	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TSSC4-208	ENST00000467308	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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