RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 MYL12AP19105 171 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 GZMHP20718 246 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SOX2P48431 317 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 BLCAPP62952 87 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PAX5Q02548 391 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 RSU1Q15404 277 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM219Q86XT9 240 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM106AQ96A25 262 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 COQ2Q96H96 371 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM80Q96HE8 168 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 METTL9Q9H1A3 318 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IL36GQ9NZH8 169 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ING4Q9UNL4 249 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 MEIKINA0A087WXM9 373 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 EFCAB10A6NFE3 127 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 GABRPO00591 440 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 FBXO24O75426 580 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HTR3BO95264 441 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 BDKRB2P30411 391 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 MNDAP41218 407 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PPP3R1P63098 170 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 GPR176Q14439 515 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00596Q86U02 117 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CDH26Q8IXH8 852 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OSR2Q8N2R0 312 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR52N1Q8NH53 320 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR9G1Q8NH87 305 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CYGBQ8WWM9 190 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 GGHQ92820 318 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 GHSRQ92847 366 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SMIM19Q96E16 107 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 S100A13Q99584 98 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OCSTAMPQ9BR26 566 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IFT22Q9H7X7 185 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 KIF25Q9UIL4 384 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 J3QR06 171 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 M0QZK8 103 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 XPNPEP2O43895 674 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 OR2F2O95006 317 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CDRT1O95170 752 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CLIC3O95833 236 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 IL1AP01583 271 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CD1AP06126 327 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM106CPP0CH98 169 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CD28P10747 220 aa5.83□□□□□ -1.48
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