RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM157AC9JC47 383 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 SYNGR1O43759 233 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 PRKACAP17612 351 aa14.52□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 AKR1C3P42330 323 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-207ENST00000462494 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.52□□□□□ -0.08
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ACTB-207ENST00000462494 C3orf80F5H4A9 247 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 NDUFA2O43678 99 aa14.51□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.096e-17■■■□□ 16.2
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ACTB-207ENST00000462494 ARR3P36575 388 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 KCNJ3P48549 501 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 Q6ZS49 121 aa14.5□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 POM121Q96HA1 1249 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 KPTNQ9Y664 436 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 HEXAP06865 529 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.49□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 IGSF23A1L1A6 192 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 KIR2DS4P43632 304 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 VAMP2P63027 116 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 KIR2DS1Q14954 304 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 SPIN2AQ99865 258 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 PRSS50Q9UI38 385 aa14.49□□□□□ -0.09
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