RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM82A0PJX8 343 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 F8VVB4 439 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 F8VWA3 439 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 SPINT2O43291 252 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF737O75373 536 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 ARL6IP5O75915 188 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CDK1P06493 297 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 FSTP19883 344 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR3A1P47881 315 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR3A4PP47883 348 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 AQP4P55087 323 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 SPHARQ15513 63 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 C6orf183Q5T699 404 aa7.3□□□□□ -1.24
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DDX39B-216ENST00000462421 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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DDX39B-216ENST00000462421 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CDH26Q8IXH8 852 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 SVOPQ8N4V2 548 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 TFAP2CQ92754 450 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CNBD2Q96M20 576 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CDCA4Q9BXL8 241 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 GHRLQ9UBU3 117 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 A0A1W2PPK0 400 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 AIPO00170 330 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 PSPNO60542 156 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CDRT1O95170 752 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CD1AP06126 327 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 GNAO1P09471 354 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 FAM106CPP0CH98 169 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 GZMHP20718 246 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 LMO1P25800 156 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 GLIPR1P48060 266 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 ZP1P60852 638 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 TAF9Q16594 264 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 LTC4SQ16873 150 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF626Q68DY1 528 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 TNFRSF14Q92956 283 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 TOMM40LQ969M1 308 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MUL1Q969V5 352 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 IL36GQ9NZH8 169 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 DPM3Q9P2X0 92 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OOSP1A8MZH6 123 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 M0QZK8 103 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 FCN3O75636 299 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 IL1AP01583 271 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 IGKV1D-12P01611 117 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MYL9P24844 172 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 PSMD7P51665 324 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 DLX1P56177 255 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MADCAM1Q13477 382 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 HES1Q14469 280 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 PIGYQ3MUY2 71 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 XAF1Q6GPH4 301 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 OR9G1Q8NH87 305 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 CORO2AQ92828 525 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-216ENST00000462421 DERL3Q96Q80 235 aa7.28□□□□□ -1.24
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