RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ABI3Q9P2A4 366 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF292O60281 2723 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 A0A1W2PR80 420 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CD300LBA8K4G0 201 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ST8SIA3O43173 380 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TK1P04183 234 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 GLAP06280 429 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 PPT1P50897 306 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CLINT1Q14677 625 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 MIDNQ504T8 468 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SVIPQ8NHG7 77 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TECTBQ96PL2 329 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SEC11CQ9BY50 192 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 Q9N2K0 584 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 MED12LQ86YW9 2145 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 NUDT19A8MXV4 375 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 LINC01387J3KSC0 135 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 GPR137BO60478 399 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TNFSF15O95150 251 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SNAPINO95295 136 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TSPAN15O95858 294 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 PRH1P02810 166 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CD59P13987 128 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CA6P23280 308 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 WNT5AP41221 380 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 UCP3P55916 312 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 FGF12P61328 243 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-204ENST00000451422 OR2T2Q6IF00 324 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF695Q8IW36 515 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 MKXQ8IYA7 352 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 LRTM2Q8N967 370 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 UBALD1Q8TB05 177 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SVILO95425 2214 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 ARGFXA6NJG6 315 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SLC22A20A6NK97 555 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 H7C2Y5 167 aa6.44□□□□□ -1.38
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ANKRD28-204ENST00000451422 RHBDL1O75783 438 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 NAPSAO96009 420 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 MT-CO3P00414 261 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SP1P08047 785 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 SP9P0CG40 484 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CAMLGP49069 296 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 F2RL1P55085 397 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 GNMTQ14749 295 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TGIF1Q15583 401 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 HFEQ30201 348 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 NRN1LQ496H8 165 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 KIRREL1Q96J84 757 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 GPR87Q9BY21 358 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 PARP11Q9NR21 331 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-204ENST00000451422 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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