RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ATP6V0CP27449 155 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 FOXO1Q12778 655 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 STUMQ69YW2 141 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ACSM6Q6P461 480 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 IL22RA2Q969J5 263 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM122AQ96E09 287 aa9.82□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM74A7A6NL05 159 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ST8SIA5O15466 376 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 GNG4P50150 75 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 PIGYQ3MUY2 71 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TIMD4Q96H15 378 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 SULT1A2P50226 295 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ROM1Q03395 351 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF383Q8NA42 475 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF721Q8TF20 911 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 MARVELD3Q96A59 401 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 GNB4Q9HAV0 340 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PQF6 199 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 M0R143 59 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM56Q96MV1 263 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 MFRPQ9BY79 579 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 GYPAP02724 150 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 SPINK2P20155 84 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 CRYBA2P53672 197 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 H2BFSP57053 126 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 GAB4Q2WGN9 574 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 UCN2Q96RP3 112 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 MANBALQ9NQG1 85 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 GPR132Q9UNW8 380 aa9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 SHISA3A0PJX4 238 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZP4Q12836 540 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 C4orf51C9J302 202 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 SSPNQ14714 243 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 NHLRC3Q5JS37 347 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM230Q96A57 120 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PP11 408 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 FGF2P09038 288 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2M3Q8NG83 312 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 DYRK2Q92630 601 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 C11orf94C9JXX5 98 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 BCL3P20749 454 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 MEOX1P50221 254 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 NHLH2Q02577 135 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 NGFRP08138 427 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 CRISP2P16562 243 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 CCKARP32238 428 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 AMTP48728 403 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 OR5I1Q13606 314 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 LRRC29Q8WV35 223 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.79□□□□□ -0.84
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2H1Q9GZK4 316 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms