RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 PEX14O75381 377 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 CCDC58Q4VC31 144 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 OR2G6Q5TZ20 316 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 ASCL4Q6XD76 172 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 C16orf82Q7Z2V1 217 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 ZNF555Q8NEP9 628 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 GPR148Q8TDV2 347 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 STMN2Q93045 179 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 RDH12Q96NR8 316 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 GPER1Q99527 375 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 MMP28Q9H239 520 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 LIN7BQ9HAP6 207 aa21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 H3BUI4 141 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 TOR1AO14656 332 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 MAGEB3O15480 346 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 DCKP27707 260 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 BRS3P32247 399 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 IL13RA2Q14627 380 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 PIGYQ3MUY2 71 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 OR10K1Q8NGX5 313 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 KIRREL1Q96J84 757 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 KIF25Q9UIL4 384 aa21.77■■□□□ 1.08
LMO1-202ENST00000428101 CLIC3O95833 236 aa21.76■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 PRRX1P54821 245 aa21.76■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR13A1Q8NGR1 328 aa21.76■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CREB3L1Q96BA8 519 aa21.76■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ALDOBP05062 364 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 NFYBP25208 207 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CEACAM3P40198 252 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 GLP1RP43220 463 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR3A4PP47883 348 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 RSU1Q15404 277 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ZNF565Q8N9K5 539 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 TMEM106AQ96A25 262 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 SLC25A33Q9BSK2 321 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 FAM192AQ9GZU8 254 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 LINC00574Q9H8X3 128 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CALYQ9NYX4 217 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ZNF581Q9P0T4 197 aa21.75■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 MEIKINA0A087WXM9 373 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OGG1O15527 345 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 AMY1AP04745 511 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 AMY2AP04746 511 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CD2P06729 351 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ARHGDIBP52566 201 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 PAX5Q02548 391 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR5AU1Q8NGC0 362 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 R3HDM4Q96D70 268 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 AKR1E2Q96JD6 320 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 BARHL1Q9BZE3 327 aa21.74■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR2F2O95006 317 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CDRT1O95170 752 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 HTR3BO95264 441 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CD83Q01151 205 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR4F17Q8NGA8 305 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR9G1Q8NH87 305 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR4F4Q96R69 305 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 TMEM138Q9NPI0 162 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 BABAM2Q9NXR7 383 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CLEC2DQ9UHP7 191 aa21.73■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OOSP1A8MZH6 123 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 LALBAP00709 142 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ABCA11PQ4W5N1 156 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 LEAP2Q969E1 77 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ORAI1Q96D31 301 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 SMIM19Q96E16 107 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ZNF281Q9Y2X9 895 aa21.72■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 J3QR06 171 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 IL1AP01583 271 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 IGHV3-7P01780 117 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 LPLP06858 475 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 KCNJ3P48549 501 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 SUMF2Q8NBJ7 301 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 OR13C5Q8NGS8 318 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 MRGPRDQ8TDS7 321 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 IFT22Q9H7X7 185 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 IL36GQ9NZH8 169 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ING4Q9UNL4 249 aa21.71■■□□□ 1.07
LMO1-202ENST00000428101 ST3GAL6Q9Y274 331 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms