RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MFFQ9GZY8 342 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR51I2Q9H344 312 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00862A6NCI5 91 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 PRRG2O14669 202 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CGAP01215 116 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 IFNA2P01563 188 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 BCL3P20749 454 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 IL32P24001 234 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 PSMB6P28072 239 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TIMP3P35625 211 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DS4P43632 304 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 NPBWR2P48146 333 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS12P56730 875 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SORDQ00796 357 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MZT1Q08AG7 82 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DS1Q14954 304 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CDSNQ15517 529 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KCTD9Q7L273 389 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SLC51BQ86UW2 128 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 WDR31Q8NA23 367 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SPERTQ8NA61 448 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SLAMF9Q96A28 289 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 GSX2Q9BZM3 304 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TREM2Q9NZC2 230 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf51A6NDU8 294 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 B3GALNT1O75752 331 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TNFSF13O75888 250 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 LYZL6O75951 148 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MPC2O95563 127 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 NAPSAO96009 420 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV1-44P01699 117 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 PET100P0DJ07 73 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF728P0DKX0 622 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 GLRA1P23415 457 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ESCO2Q56NI9 601 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SHEQ5VZ18 495 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T2Q6IF00 324 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR8H3Q8N146 312 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 MOB3AQ96BX8 217 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 STARD4Q96DR4 205 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 GALNT14Q96FL9 552 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ARL6Q9H0F7 186 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 Q9N2K0 584 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 ZFP57Q9NU63 452 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 KIF25Q9UIL4 384 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 HCFC1P51610 2035 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 OR5H1A6NKK0 313 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 FAM25EA8MYX2 175 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TRDCB7Z8K6 153 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 DIRAS3O95661 229 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 IFNA21P01568 189 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-204ENST00000424089 TK1P04183 234 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms