RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 ARHGDIBP52566 201 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 AKR1C2P52895 323 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 AKR1C1Q04828 323 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 HPSE2Q8WWQ2 592 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 SPIN2AQ99865 258 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 TMEM222Q9H0R3 208 aa20.4■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 C5orf49A4QMS7 147 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 TK1P04183 234 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 BCL3P20749 454 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 PLP2Q04941 152 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 HMGN3Q15651 99 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 VASH2Q86V25 355 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 MPC1Q9Y5U8 109 aa20.39■□□□□ 0.86
PMS1-205ENST00000409985 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 TUSC2O75896 110 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 SCGB1D2O95969 90 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 IGHV3-9P01782 118 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 NME2P22392 152 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 TMEM251Q8N6I4 163 aa20.39■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 CALHM2Q9HA72 323 aa20.39■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 TRDCB7Z8K6 153 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 TRAPPC2LH3BP13 241 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 HLA-HP01893 362 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 CELA3AP09093 270 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 DANCRP0C864 163 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 SPP1P10451 314 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 MAGEA5P43359 124 aa20.38■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 SRYQ05066 204 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 CLN3Q13286 438 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 FAM219AQ8IW50 185 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 ERGIC1Q969X5 290 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa20.38■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 PRELID1Q9Y255 219 aa20.38■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 C11orf1Q9H5F2 150 aa20.37■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.37■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 IL22RA2Q969J5 263 aa20.37■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 TP53RKQ96S44 253 aa20.37■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.35■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.35■□□□□ 0.85
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PMS1-205ENST00000409985 OR52M1Q8NGK5 317 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 PKIBQ9C010 78 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 FAM157AC9JC47 383 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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