RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 G6PCP35575 357 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS12P56730 875 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CD226Q15762 336 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FAM209BQ5JX69 171 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FAM78BQ5VT40 261 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MANBALQ9NQG1 85 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CORTO00230 105 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF205O95201 554 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LGALS7P47929 136 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TCTAP57738 103 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PAFAH1B2P68402 229 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 HIST3H3Q16695 136 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 DYRK2Q92630 601 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MISP3Q96FF7 219 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LILRA5A6NI73 299 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OR5B21A6NL26 309 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF737O75373 536 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CD81P60033 236 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 IL24Q13007 206 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TP53RKQ96S44 253 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 NAA60Q9H7X0 242 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 NPY1RP25929 384 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ID4P47928 161 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF117Q03924 483 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 WNT2BQ93097 391 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PR80 420 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 GREM1O60565 184 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB1A1P11684 91 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-GP17693 338 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OR1C1Q15619 314 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 BSXQ3C1V8 233 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PDPNQ86YL7 162 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OR4S2Q8NH73 311 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 IL17BQ9UHF5 180 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 MOSPD3O75425 235 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 TNFSF15O95150 251 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CD40P25942 277 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RAB9AP51151 201 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 RELBQ01201 579 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LYG1Q8N1E2 194 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 B4DEV8 164 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 K7ERU9 68 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01565O15544 149 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 GABRG2P18507 467 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LPAR6P43657 344 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 CACNG5Q9UF02 275 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-202ENST00000400053 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 A6NJY4 79 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 SOCS1O15524 211 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 CDC14BO60729 498 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.16
PTPRM-202ENST00000400053 DLK1P80370 383 aa7.84□□□□□ -1.16
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