RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RNF2Q99496 336 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 PHOX2AO14813 284 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBA1P05813 215 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF260Q3ZCT1 412 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf57Q99622 126 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 CCL28Q9NRJ3 127 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 GGTLC2Q14390 218 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A40Q8TBP6 338 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0J9YW62 118 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 OR52L2PQ8NGH6 319 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TOLLIPQ9H0E2 274 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ASAH2BP0C7U1 165 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL3P19876 107 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 LYPD8Q6UX82 237 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 SSX7Q7RTT5 188 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB34Q8NCN2 500 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 MBPP02686 304 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 HPXP02790 462 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 CD1AP06126 327 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TNXAQ16473 311 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 DTD1Q8TEA8 209 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 RAB33BQ9H082 229 aa17.76■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 GALR1P47211 349 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 OR2W1Q9Y3N9 320 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 SPINK2P20155 84 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DRB3P79483 266 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 MOGAT2Q3SYC2 334 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 C1RLQ9NZP8 487 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM210A6NLX4 147 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 GATCO43716 136 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 DYNLT3P51808 116 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 RANP62826 216 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5SQ99766 215 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF665Q9H7R5 613 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM167BQ9NRX6 74 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 OR8B3Q8NGG8 313 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 OR8B2Q96RD0 313 aa17.75■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf97H3BN30 126 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 K7ESF4 209 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 LPAR3Q9UBY5 353 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TTRP02766 147 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ORM2P19652 201 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 SPCS3P61009 180 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00596Q86U02 117 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 GYPAP02724 150 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 OR4A4PQ8NGN8 299 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 RBFOX3A6NFN3 312 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 FAM157AC9JC47 383 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 FABP4P15090 132 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 DOK5Q9P104 306 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 UBR3Q6ZT12 1888 aa17.74■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 AGFG2O95081 481 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 PIGYQ3MUY2 71 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 SSX8Q7RTT4 187 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 FAM24BQ8N5W8 94 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TTTY12Q9BZ98 90 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 OR2J3O76001 311 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ZPLD1Q8TCW7 415 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 BLNKQ8WV28 456 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 FAM210BQ96KR6 192 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN2O60636 221 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 IFI6P09912 130 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF79Q15937 498 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 PRR13Q9NZ81 148 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 PMCHP20382 165 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf35Q6ZS72 473 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 HOGA1Q86XE5 327 aa17.73■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC9AQ6UXN8 241 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf42Q8N5U0 333 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 Q9N2K0 584 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0U1RQV5 110 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 UPK3AO75631 287 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 LIMS1P48059 325 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 MDP1Q86V88 176 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf174Q8IYL3 243 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 RNF122Q9H9V4 155 aa17.72■□□□□ 0.43
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H3AP68431 136 aa17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms