RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FAM24BQ8N5W8 94 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OR4A4PQ8NGN8 299 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM38BQ9NVV0 291 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV34A0A0B4J273 112 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM52Q8NDY8 209 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TOLLIPQ9H0E2 274 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35B3Q9H1N7 401 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CLRN3Q8NCR9 226 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 BCORQ6W2J9 1755 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf97H3BN30 126 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 BGLAPP02818 100 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ASCL5Q7RTU5 278 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf67F2Z3F1 127 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 PCMT1P22061 227 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SLC7A10Q9NS82 523 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ARG1P05089 322 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 MGPP08493 103 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OR10D4PQ8NGN7 298 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 DYNLRB2Q8TF09 96 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ORM1P02763 201 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CELA2AP08217 269 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1FQ16864 119 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 DTD1Q8TEA8 209 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5SQ99766 215 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RABAC1Q9UI14 185 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RPL30P62888 115 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SYNGR2O43760 224 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF488Q96MN9 340 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SRD5A3Q9H8P0 318 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA7AO75326 666 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 VWA1Q6PCB0 445 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SCAND1P57086 179 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 MGAT2Q10469 447 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf35Q6ZS72 473 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OR1K1Q8NGR3 316 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 HARBI1Q96MB7 349 aa19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 COL10A1Q03692 680 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CLLU1Q5K131 121 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OR1L1Q8NH94 360 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF721Q8TF20 911 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CBY3A6NI87 242 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RANP62826 216 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN34H7C241 214 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 PMS2P11Q13670 270 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OGG1O15527 345 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-GP17693 338 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RPS4Y2Q8TD47 263 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 MRGPRFQ96AM1 343 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQF6 199 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 IL24Q13007 206 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 MYO7AQ13402 2215 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 IL22RA2Q969J5 263 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 VSIG4Q9Y279 399 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CDRT15L2A8MXV6 281 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 J3QR89 54 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 IL11P20809 199 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CD82P27701 267 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OR2J1Q9GZK6 312 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RNF212Q495C1 297 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf185Q5T7R7 199 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CLN8Q9UBY8 286 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV4-34P06331 123 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 FBXW9Q5XUX1 488 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 FDX2Q6P4F2 183 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OR4X1Q8NH49 305 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CA10Q9NS85 328 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM116Q8NCL8 245 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 LSMEM1Q8N8F7 131 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 C1RLQ9NZP8 487 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 CES1P1Q9UKY3 287 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 USP54Q70EL1 1684 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 HLA-DRB3P79483 266 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T8A6NH00 312 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 PPYP01298 95 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 FAM87AP0C7U9 286 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC3BQ96PB8 259 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 RBFOX3A6NFN3 312 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 WNT5AP41221 380 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 C21orf58P58505 322 aa19.58■□□□□ 0.73
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A10Q8NG04 563 aa19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms