RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.8□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.8□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 MARCH11A6NNE9 402 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ZNF878C9JN71 531 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 E9PLN8 166 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 DOK2O60496 412 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CYB5AP00167 134 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CGAP01215 116 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 H2BFMP0C1H6 154 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CX3CR1P49238 355 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 TNFRSF9Q07011 255 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 FDX2Q6P4F2 183 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 VWA1Q6PCB0 445 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ACBD4Q8NC06 268 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR5R1Q8NH85 324 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 AMELYQ99218 206 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CENPMQ9NSP4 180 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CACNA1CQ13936 2221 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BKO60814 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR2C1O95371 312 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BJP06899 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BOP23527 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BBP33778 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 UCP2P55851 309 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BDP58876 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BCP62807 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 PMPCAQ10713 525 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 P2RY6Q15077 328 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZRG5 221 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.79□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR5H1A6NKK0 313 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 UMAD1C9J7I0 102 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 PPP1R2P9O14990 202 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 RER1O15258 196 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ADAP1O75689 374 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 MBP02144 154 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CSN2P05814 226 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ARR3P36575 388 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 SNCAP37840 140 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 RAB35Q15286 201 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 MUCL1Q96DR8 90 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 BOD1Q96IK1 185 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 PRRT1Q99946 306 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 LRP12Q9Y561 859 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 ZNF32P17041 273 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 VAMP1P23763 118 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 HSD11B1P28845 292 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CA7P43166 264 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 GUK1Q16774 197 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 COMMD1Q8N668 190 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 NAXEQ8NCW5 288 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 GPR148Q8TDV2 347 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 TMEM106AQ96A25 262 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 R4GMQ9 66 aa8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
GINS3-201ENST00000318129 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.9 ms