RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.38■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC23A3Q6PIS1 610 aa15.38■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SPTSSAQ969W0 71 aa15.38■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ST8SIA3O43173 380 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 EPHA1P21709 976 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SRD5A2P31213 254 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PP6455Q8WZ26 134 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 C14orf144Q96I85 54 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ARV1Q9H2C2 271 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 IGSF23A1L1A6 192 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PMELP40967 661 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 RSU1Q15404 277 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM189A2Q15884 450 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 GGNQ86UU5 652 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF429Q86V71 674 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 YPEL4Q96NS1 127 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TREM2Q9NZC2 230 aa15.37■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 H3BP45 60 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 K7N7A8 449 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 CXCL13O43927 109 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF774Q6NX45 483 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 HAS2Q92819 552 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 HSD17B6O14756 317 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ALDH3B1P43353 468 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 UCP2P55851 309 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 KHDC3LQ587J8 217 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.36■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZXDAP98168 799 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 DEPPQ9NTK1 212 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 B4E171 279 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 B4GALT1P15291 398 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TSPAN7P41732 249 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 GNMTQ14749 295 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PPA1Q15181 289 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SPIN3Q5JUX0 258 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR2T2Q6IF00 324 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR5C1Q8NGR4 320 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 CT55Q8WUE5 264 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 MALSU1Q96EH3 234 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 NCKAP5O14513 1909 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF716A6NP11 495 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 C3orf80F5H4A9 247 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 HSPB6O14558 160 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 IGHEP01854 428 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 DUSP1P28562 367 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 NDUFB7P17568 137 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 CRYGSP22914 178 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 Q6ZPA2 131 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 AAED1Q7RTV5 226 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR2C3Q8N628 320 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 OR10D3Q8NH80 312 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 Q96M66 194 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 SYNGR3O43761 229 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 AADACP22760 399 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 Q6ZSR3 168 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 FRZBQ92765 325 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 BOD1Q96IK1 185 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 GLRX2Q9NS18 164 aa15.34■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 ZFHX4Q86UP3 3567 aa15.33■□□□□ 0.05
TSPAN17-201ENST00000298564 PINLYPA6NC86 204 aa15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 LCATP04180 440 aa15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 TRGC1P0CF51 173 aa15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF32P17041 273 aa15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 CLDN15P56746 228 aa15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB35Q15286 201 aa15.33■□□□□ 0.04
TSPAN17-201ENST00000298564 SSX9Q7RTT3 188 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms