RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 OR10G8Q8NGN5 311 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf94C9JXX5 98 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ARG1P05089 322 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 IFITM3Q01628 133 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 FAM74A3Q4VXF1 159 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00596Q86U02 117 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC16Q969W1 377 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR2W1Q9Y3N9 320 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM6Q9BX84 2022 aa18.56■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GU03 582 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 MFNGO00587 321 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 BCL3P20749 454 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf40Q8IXQ3 194 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 NHLH1Q02575 133 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 NHLH2Q02577 135 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 BLNKQ8WV28 456 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C5Q8NGB2 326 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 WDR54Q9H977 334 aa18.55■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GTQ1 180 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CDIPTO14735 213 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 EFNB2P52799 333 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPRGQ86SM5 289 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR4A4PQ8NGN8 299 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF18Q9UNG2 199 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 C21orf140B9A014 251 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TCAPO15273 167 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ERVS71-1P61550 626 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PCM1Q15154 2024 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 NGFRP08138 427 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CCL3P10147 92 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CRISP2P16562 243 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ZP4Q12836 540 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 LYZL2Q7Z4W2 148 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PDPNQ86YL7 162 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CBLN2Q8IUK8 224 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 GRAMD2BQ96HH9 432 aa18.54■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SNCGO76070 127 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf57Q0VDD7 668 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TRIP11Q15643 1979 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PPIHO43447 177 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 MOSPD3O75425 235 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 LIFP15018 202 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SPEM2Q0P670 501 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF260Q3ZCT1 412 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 DOK5Q9P104 306 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AL1P0C617 328 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 GOSR1O95249 250 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ORM2P19652 201 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 FSTP19883 344 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR10A7Q8NGE5 316 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 OR2I1PQ8NGU4 316 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 DTX4Q9Y2E6 619 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TPRP12270 2363 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 RPL29P47914 159 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SOX8P57073 446 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 HES3Q5TGS1 186 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM65Q6PI78 240 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF721Q8TF20 911 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 ISOC2Q96AB3 205 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 NAAAQ02083 359 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT2Q10469 447 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 FOXC1Q12948 553 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 Q1RN00 199 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SPNS3Q6ZMD2 512 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35E3Q7Z769 313 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPC1 479 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 DXOO77932 396 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 CCL4P13236 92 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PNLIPP16233 465 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 COX7A1P24310 79 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 DLK1P80370 383 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 RAB1CQ92928 201 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 UCN2Q96RP3 112 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 RAB33BQ9H082 229 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 PRO1933Q9H354 126 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-201ENST00000284617 K7ESF4 209 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM6P0DI80 62 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 KIR3DL2P43630 455 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 LIMS1P48059 325 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FAM219AQ8IW50 185 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL4Q9BY76 406 aa18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.4 ms