RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 OR8U1Q8NH10 309 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 TGFBR1P36897 503 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 HTR2BP41595 481 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 NAAAQ02083 359 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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PTPN3-201ENST00000262539 PHYHD1Q5SRE7 291 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ACSM6Q6P461 480 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 TIMP4Q99727 224 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 DBX1A6NMT0 343 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 NEURL1O76050 574 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 HLA-HP01893 362 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ACKR3P25106 362 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPN3-201ENST00000262539 TM2D1Q9BX74 207 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 GSX2Q9BZM3 304 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 IL18BPO95998 194 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 IAPPP10997 89 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 G0S2P27469 103 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPN3-201ENST00000262539 OR4C16Q8NGL9 310 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 SPSB4Q96A44 273 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 TVP23CQ96ET8 276 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 IL17BQ9UHF5 180 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 V9GYS6 101 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 PROB1E7EW31 1015 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A6P12236 298 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPN3-201ENST00000262539 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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PTPN3-201ENST00000262539 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPN3-201ENST00000262539 CD200P41217 278 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 P2RY4P51582 365 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPN3-201ENST00000262539 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM235A6NFC5 223 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 LGALS7P47929 136 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 SELENOPP49908 381 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 CLDN18P56856 261 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 C4orf17Q53FE4 359 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 GPR31O00270 319 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 UCP3P55916 312 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 Q6ZT83 130 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 J3KRW8 73 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 PNPP00491 289 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 AMTP48728 403 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF546Q86UE3 836 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 GALMQ96C23 342 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPN3-201ENST00000262539 SEC22AQ96IW7 307 aa7.16□□□□□ -1.26
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