RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 RIGQ13278 110 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 RAB32Q13637 225 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CD226Q15762 336 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB124Q8NES8 71 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SPACA5Q96QH8 159 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SHISA5Q8N114 240 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 IL36GQ9NZH8 169 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 GPR27Q9NS67 375 aa7.91□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 MGST3O14880 152 aa7.91□□□□□ -1.14
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PTPRB-201ENST00000261266 UCP3P55916 312 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 CBR1P16152 277 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 C10orf128Q5T292 105 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-201ENST00000261266 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.91□□□□□ -1.14
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