RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ADAM19Q9H013 955 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RAB18Q9NP72 206 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 LEUTXA8MZ59 168 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZIC3O60481 467 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CXCL2P19875 107 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 KLK2P20151 261 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 COX5AP20674 150 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CHRNA7P36544 502 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RPS23P62266 143 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RUNX1Q01196 453 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 DEFA6Q01524 100 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF90Q03938 601 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 MPV17LQ2QL34 196 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SIGIRRQ6IA17 410 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 MDP1Q86V88 176 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 LFNGQ8NES3 379 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RAB33BQ9H082 229 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PPE2 198 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PR64 198 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PRV1 198 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF320A2RRD8 509 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TSTD3H0UI37 97 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 PHOX2AO14813 284 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SCGB2A1O75556 95 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CHRNB4P30926 498 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 REG1BP48304 166 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 IFITM2Q01629 132 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CARFQ8N187 725 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SAP25Q8TEE9 199 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 C12orf57Q99622 126 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 GINS3Q9BRX5 216 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 LPAR5Q9H1C0 372 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 PRSS50Q9UI38 385 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ARID2Q68CP9 1835 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 KLF4O43474 513 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RECKO95980 971 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ZNF17P17021 662 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RAB5CP51148 216 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 HMGN3Q15651 99 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 APCDD1LQ8NCL9 501 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 M1APQ8TC57 530 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 RND1Q92730 232 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 GTF3C1Q12789 2109 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 C7orf66A4D0T2 115 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 HPP00738 406 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 IGKV3-11P04433 115 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CELA3AP09093 270 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 SCTP09683 121 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CT45A6P0DMU7 189 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CT45A5P0DMU8 189 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 CT45A7P0DMV0 189 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-201ENST00000261169 DYNLT3P51808 116 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms