RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 PSG5Q15238 335 aa14.17□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 GAPTQ8N292 157 aa14.17□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 OR2M5A3KFT3 312 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 SHISA7A6NL88 538 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 HES1Q14469 280 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 FDX2Q6P4F2 183 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 GPR27Q9NS67 375 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 LRRC30A6NM36 301 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 HAND1O96004 215 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 MESTQ5EB52 335 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 SP1P08047 785 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 OR13H1Q8NG92 308 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 SNCGO76070 127 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 MYBPHQ13203 477 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 ISXQ2M1V0 245 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 PARLQ9H300 379 aa14.16□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GU03 582 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 CXorf1O96002 111 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 G6PCP35575 357 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 TMEM50BP56557 158 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PN81 502 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 MELTFP08582 738 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 RIGQ13278 110 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 RLN3Q8WXF3 142 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 P01737 135 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 EFNB1P98172 346 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 ZNF141Q15928 474 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 CTSVO60911 334 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 NGFP01138 241 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 DANCRP0C864 163 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 DEFB103AP81534 67 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 FAM53BQ14153 422 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 Q8IYB0 196 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.15□□□□□ -0.14
CTIF-201ENST00000256413 GNG3P63215 75 aa14.15□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.15□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.15□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 PATE1Q8WXA2 126 aa14.15□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 OR2V2Q96R30 315 aa14.15□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.15□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 CD74P04233 296 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 NMUP48645 174 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 CD8AP01732 235 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 TMEM230Q96A57 120 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 GPR132Q9UNW8 380 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 CXCL13O43927 109 aa14.14□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 IGSF23A1L1A6 192 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 PLPP3O14495 311 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 ZNF77Q15935 545 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 ZPBPQ9BS86 351 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 UBE2CO00762 179 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 SMIM17P0DL12 118 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 GGTLC2Q14390 218 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 TMEM56Q96MV1 263 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 ZNF205O95201 554 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 EID2BQ96D98 161 aa14.13□□□□□ -0.15
CTIF-201ENST00000256413 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms