RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MOGAT1Q96PD6 335 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 BTAF1O14981 1849 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0A6YYJ9 748 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 IGSF23A1L1A6 192 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 KCNK17Q96T54 332 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CCL13Q99616 98 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 K7N7A8 449 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SYNGR1O43759 233 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 GCSHP23434 173 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MEOX2P50222 304 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZIC1Q15915 447 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 RPEL1Q2QD12 228 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 STPG3Q8N7X2 389 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ALG14Q96F25 216 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFA2O43678 99 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 RHBDL1O75783 438 aa9.26□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 COL8A1P27658 744 aa9.26□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.26□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SFT2D2O95562 160 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PRDX2P32119 198 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 RIGQ13278 110 aa9.26□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SYT8Q8NBV8 401 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 C16orf92Q96LL3 132 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 BCL2L11O43521 198 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FOXH1O75593 365 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 P01737 135 aa9.26□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 CSRP2Q16527 193 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MPV17LQ2QL34 196 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.26□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 LINC00303Q3SY05 128 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF429Q86V71 674 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 DTD1Q8TEA8 209 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 KCNK15Q9H427 330 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SPINT1O43278 529 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZFPL1O95159 310 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 OR5AC1P0C628 307 aa9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 RNF151Q2KHN1 245 aa9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 MIOXQ9UGB7 285 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF737O75373 536 aa9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 COL10A1Q03692 680 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 PSG5Q15238 335 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 FAM78BQ5VT40 261 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.25□□□□□ -0.93
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TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.25□□□□□ -0.93
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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