RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 H3BRB1 525 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 ATP11AP98196 1134 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 GJD3Q8N144 294 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 SPACA7Q96KW9 195 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 CHRDQ9H2X0 955 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.47□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 ARHGAP4P98171 946 aa7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 EHHADHQ08426 723 aa7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.46□□□□□ -1.21
CASC19-241ENST00000641582 TNFRSF21O75509 655 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 CES1P23141 567 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 PBX4Q9BYU1 374 aa7.45□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 TM4SF5O14894 197 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 ITGB5P18084 799 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 CEP135Q66GS9 1140 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 PMEPA1Q969W9 287 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 WDR64B1ANS9 1081 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 LINC01387J3KSC0 135 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 BRD1O95696 1058 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 BEND4Q6ZU67 534 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 PIM2Q9P1W9 311 aa7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 NFKBIEO00221 500 aa7.43□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 PHACTR2O75167 634 aa7.43□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.43□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.43□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 EREGO14944 169 aa7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 ACPPP15309 386 aa7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 FBLN7Q53RD9 439 aa7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 BMP3P12645 472 aa7.41□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 MSMPQ1L6U9 139 aa7.41□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.41□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.41□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.41□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 TRPA1O75762 1119 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 PRNPP04156 253 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 CDC27P30260 824 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 ADAM19Q9H013 955 aa7.4□□□□□ -1.22
CASC19-241ENST00000641582 NDUFB5O43674 189 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 PTPRAP18433 802 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 COL19A1Q14993 1142 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 FBXL18Q96ME1 805 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 HHIPQ96QV1 700 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 CITED4Q96RK1 184 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 FAM129BQ96TA1 746 aa7.39□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 EDN3P14138 238 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.38□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 IGHA2P01877 340 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 FOSL1P15407 271 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 EPHA1P21709 976 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 PREPP48147 710 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 PDE3BQ13370 1112 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 NXPE3Q969Y0 559 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 OSMRQ99650 979 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.37□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 FSCN2O14926 492 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 ADAM11O75078 769 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-241ENST00000641582 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms