RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ADD2P35612 726 aa29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLX4Q8IY92 1834 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-215ENST00000628018 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.95■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA4P34932 840 aa29.95■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 APPBP2Q92624 585 aa29.95■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 POLD1P28340 1107 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE3CQ15386 1083 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 OLFM4Q6UX06 510 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MPNDQ8N594 471 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP4K1Q92918 833 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBP2Q969R2 916 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MAST3O60307 1309 aa29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 ANAPC15P60006 121 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.91■■■□□ 2.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.9■■■□□ 2.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 NECTIN1Q15223 517 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.89■■■□□ 2.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 RABEP1Q15276 862 aa29.87■■■□□ 2.37
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CAPNS1-215ENST00000628018 ABCF2Q9UG63 623 aa29.87■■■□□ 2.37
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CAPNS1-215ENST00000628018 EYA3Q99504 573 aa29.83■■■□□ 2.37
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CAPNS1-215ENST00000628018 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
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CAPNS1-215ENST00000628018 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX21Q969T3 373 aa29.82■■■□□ 2.36
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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CAPNS1-215ENST00000628018 AIDAQ96BJ3 306 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 MECOMQ03112 1051 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CD2APQ9Y5K6 639 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.77■■■□□ 2.36
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