RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.14■■□□□ 1.94
NME4-211ENST00000620944 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
NME4-211ENST00000620944 MEIS3Q99687 375 aa27.14■■□□□ 1.94
NME4-211ENST00000620944 A0A1B0GUL6 1792 aa27.14■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 EYA2O00167 538 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 TRIM27P14373 513 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 DLGAP5Q15398 846 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 CERS5Q8N5B7 392 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 BEGAINQ9BUH8 593 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.13■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.12■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 SIL1Q9H173 461 aa27.12■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 WBP1LQ9NX94 342 aa27.12■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.11■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.11■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 FOXN1O15353 648 aa27.1■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.1■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.1■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 MYO1BO43795 1136 aa27.09■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 AOC2O75106 756 aa27.09■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 MAP2K2P36507 400 aa27.09■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 FBXO3Q9UK99 471 aa27.09■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 SLC5A1P13866 664 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 NF2P35240 595 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 RGMBQ6NW40 437 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 FBXO33Q7Z6M2 555 aa27.08■■□□□ 1.93
NME4-211ENST00000620944 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 CIAO1O76071 339 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 CFAP100Q494V2 611 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 FKBP1BP68106 108 aa27.06■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 NOGQ13253 232 aa27.06■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.06■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 LPIN2Q92539 896 aa27.06■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 BCAMP50895 628 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 TNNQ9UQP3 1299 aa27.05■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 SRGAP3O43295 1099 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 FGFR2P21802 821 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 IFFO2Q5TF58 517 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 CCDC102AQ96A19 550 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 GNAI2P04899 355 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 SPDYE6P0CI01 402 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 ATP2B3Q16720 1220 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 TNS4Q8IZW8 715 aa27.02■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 VEZTQ9HBM0 779 aa27.02■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 COPRSQ9NQ92 184 aa27.02■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.02■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 THSD7BQ9C0I4 1608 aa27.01■■□□□ 1.92
NME4-211ENST00000620944 CLRN2A0PK11 232 aa27.01■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.01■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.01■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 LBX1P52954 281 aa27■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 DEFB129Q9H1M3 183 aa27■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.99■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 CA12O43570 354 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 MTX1Q13505 466 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 PRKG1Q13976 671 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 MOB2Q70IA6 237 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 SLC10A3P09131 477 aa26.96■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 CRKP46108 304 aa26.96■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 TNFAIP1Q13829 316 aa26.96■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 MAST3O60307 1309 aa26.95■■□□□ 1.91
NME4-211ENST00000620944 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.95■■□□□ 1.9
NME4-211ENST00000620944 TEKT1Q969V4 418 aa26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms