RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619533.1

CNTNAP4-208, Transcript of contactin associated protein like 4, human

Gene CNTNAP4, Length 1,856 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP4-208	ENST00000619533	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZIC5	Q96T25	663 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF609	O15014	1411 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CSF1R	P07333	972 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FAM161A	Q3B820	660 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DACT2	Q5SW24	774 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MXD3	Q9BW11	206 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SCN9A	Q15858	1988 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC10A3	P09131	477 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MMP14	P50281	582 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CASP7	P55210	303 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FKBP1B	P68106	108 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SPEF2	Q9C093	1822 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NF2	P35240	595 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	GTF2I	P78347	998 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CHRND	Q07001	517 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MYH3	P11055	1940 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533		F6X3S4	739 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TRPA1	O75762	1119 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SASH1	O94885	1247 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	KLRK1	P26718	216 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FOXO4	P98177	505 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	BEND3	Q5T5X7	828 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RNF186	Q9NXI6	227 aa		7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PLIN1	O60240	522 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TAF5L	O75529	589 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PSME4	Q14997	1843 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CD209	Q9NNX6	404 aa		7.63	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	GRM8	O00222	908 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	WNT10B	O00744	389 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ALDH1L1	O75891	902 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DLGAP5	Q15398	846 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MOB2	Q70IA6	237 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PDE4C	Q08493	712 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PRKG1	Q13976	671 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SPOCK2	Q92563	424 aa		7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533		F8W031	263 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SNAP23	O00161	211 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CACNA1F	O60840	1977 aa		7.61	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MYO1B	O43795	1136 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IL1R1	P14778	569 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CFAP100	Q494V2	611 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CERS5	Q8N5B7	392 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.6	□□□□□ -1.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms